王炳波

个人信息:Personal Information

教授

性别:男

毕业院校:beoplay体育提现

学历:博士研究生毕业

学位:工学博士学位

在职信息:在岗

所在单位:计算机科学与技术学院

学科:计算机科学与技术

办公地点:主楼4区106

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个人简介:Personal Profile

王炳波,男,副教授,beoplay体育提现计算机学院、计算生物信息学研究所,计算机应用学科背景,计算机学会计算生物信息学专委会委员。个人主页https://web.xidian.edu.cn/wbb/

       从事生物网络分析方面的研究工作,对图论及组合优化理论、网络数据挖掘算法、图表示学习方法有较深厚的研究积累;在计算生物信息领域的工作主要聚焦在复杂生物网络数据分析的理论和方法,擅长以图论和机器学习为基础的算法研究;国家留学基金委全额资助在美国复杂网络研究中心(CCNR)哈佛医学院网络医学研究中心(CDNM)合作开展为期一年的研究工作;负责了国家自然科学面上项目、青年基金项目、陕西省自然科学基金项目、博士后基金项目,参与了国家自然科学基金面上、重点和重大研究计划培育项目;在本领域国际期刊《Nature Communications》、《Briefings in Bioinformatics》、《BMC Bioinformatics》、《Scientific Report》、《Europhysics Letters》、《J. Stat. Mech.》、《Physica A》、《Neurocomputing》、《IEEE/ACM TCBB》、《Frontiers in Genetics》、《中国科学》、《PLoS One》等发表了研究成果,奠定了在该领域深入开展研究工作的良好基础;荣获陕西省自然科学一等奖(第三)、中国电子学会科学技术二等奖(第三)、beoplay体育提现优秀科研成果奖、beoplay体育提现优秀博士学位论文奖;专注于在生物网络中挖掘复杂疾病的图模式


科研获奖及专利

[1]高琳,鱼亮,王炳波,郭杏莉,等。复杂疾病相关模式发现理论与方法研究,陕西省自然科学,一等奖,证书编号:2019-Z-2101-1-R03,省部级。

[2]高琳,马小科,王炳波,等。生物网络数据挖掘理论方法及应用研究,中国电子学会科学技术,二等奖,证书编号:KJ2015-Z2-03-R03,省部级。

[3]高琳,郭杏莉,孙鹏岗,鱼亮,王炳波,等。生物网络数据分析与挖掘中相关理论与关键技术,beoplay体育提现优秀科研成果奖,一等奖。

[4]王炳波。复杂网络拓扑结构度量指标及应用研究,beoplay体育提现优秀博士学位论文奖。

[5]高琳,王炳波,等。基于节点支配能力相似性的功能模块检测方法。国家发明专利:201410267391.3。

[6]王炳波,高琳,等。一种基于连通显著性的疾病模块检测方法及系统。国家发明专利:202010676457.X。

[7]王炳波,高琳,等。一种高阶控制图模式检测方法、系统、存储介质及应用。国家发明专利:202010570175.1。


计算生物信息学与数据挖掘领域近年主要论文列表

[1]Bingbo, Wang*, …, Lin Gao. The Peripheral and Core regions of Virus-Host Network of COVID-19. Briefings in Bioinformatics, 2021, 10.1093/bib/bbab169 【SCI IF=8.990, JCR=1】

[2]Chenxing zhang, Ling Gao*, Bingbo, Wang*, Yong Gao. Improving Single-Cell RNA-seq Clustering by Integrating Pathways. Briefings in Bioinformatics, 2021, 10.1093/bib/bbab147 【SCI IF=8.990, JCR=1】

[3]Bingbo, Wang*, …, Lin Gao*. CBP-JMF: an Improved Joint Matrix Tri-Factorization Method for Characterizing Complex Biological Processes of Diseases. Frontiers in Genetics, 2021, doi: 10.3389/fgene.2021.665416 【SCI IF=3.258, JCR=2】

[4]Bingbo, Wang*, …, Lin Gao. C3: connect separate connected components to form a succinct disease module. BMC Bioinformatics, 2020, 21, no. 1. 【SCI IF=3.242, JCR=2】

[5]Haiyan Jin, …, Bingbo Wang*. Inferring essential proteins from centrality in interconnected multilayer networks. Physica A: Statistical Mechanics and Its Applications, 2020, 557. 【SCI IF=2.924, JCR=2】

[6]Bingbo Wang, …, Amitabh Sharma. The periphery and the core properties explain the omnigenic model in the human interactome. bioRxiv 749358, 2019, doi: https://doi.org/10.1101/749358

[7]Bingbo Wang*, Lin Gao*, Yong Gao. Control range: a controllability-based index for node significance in directed networks. Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment, 2012, 04:P04011 【SCI IF=2.758, JCR=2】 【被引42次】

[8]Bingbo Wang, Lin Gao*. Seed selection strategy in global network alignment without destroying the entire structures of functional modules. Proteome Science, 2012, 10(Suppl 1):S16【IF=2.49】 【被引8次】

[9]Bingbo Wang*, Lin Gao*, et al.Maintain the structural controllability under malicious attacks on directed networks. Europhysics Letters,2013,101(5):58003 【SCI IF=2.171,JCR=2】 【被引28次】

[10]Bingbo Wang*, Lin Gao*, Yong Gao, Yue Deng and Yu Wang. Controllability and observability analysis for vertice domination centrality in directed networks. Scientific Reports, 2014,4:5399 【SCI IF=5.078,JCR=2】【被引24次】

[11]Bingbo Wang*, Lin Gao*.Qingfang zhang et al. Diversified Control Paths: A Significant Way Disease Genes Perturb the Human Regulatory Network. PLoS ONE,2015, 10(8): e0135491. 【SCI IF=3.73,JCR=3】 【被引9次】

[12]Yuxuan Hu, …, Bingbo Wang, Lin Gao*, Kai Tan*. Optimal control nodes in disease-perturbed networks as targets for combination therapy. Nature Communications, 2019, 10, no. 1. 【SCI IF=11.878, JCR=1】 【被引8次】


科研项目

1. 国家自然科学基金委员会,面上项目,61873198,三维基因组结构模式挖掘方法研究,2019-01至2022-12,63万,在研,参加

2. 国家自然科学基金委员会,面上项目, 61772395, 复杂疾病的结构化组织规律发现方法研究,2018-01至2021-12,63万,在研,主持

3. 国家自然科学基金委员会,重点项目,61532014,基于网络模型的癌症相关模式挖掘理论与方法,2016-01至2020-12,290万,已结题,参加

4. 陕西省自然科学基础研究计划,面上项目,2015JQ6229,复杂疾病控制过程相关子图模式发现算法研究,2015-01至2016-12,3万元,已结题,主持

5. 中央高校基本科研业务费专项资金资助,2015JM6283,生物网络系统干预模式挖掘算法研究,2015-01至2016-12,6万元,已结题,主持

6. 国家自然科学基金委员会,青年项目,61303122,有向生物网络中可控性相关子图模式发现算法研究,2014-01至2016-12,23万元,已结题,主持

7. 国家自然科学基金委员会,重大研究计划项目,91130006,复杂疾病恶化过程相关模式发现理论与方法研究,2012-01至2014-12,75万元,已结题,参加

8. 国家自然科学基金委员会,重点项目,60933009,生物网络数据分析与挖掘中相关理论与关键技术,2010-01至2013-12,220万元,已结题,参加


  • 教育经历Education Background
  • 工作经历Work Experience
  • 研究方向Research Focus
  • 社会兼职Social Affiliations
  • 复杂网络数据分析
  • 数据挖掘
  • 计算生物信息学

团队成员Research Group

计算生物信息学研究所